Workflows d'analyses de données

Qu'est ce qu'un workflow d'analyse ?

Un workflow bio-informatique est un terme communément admis dans la communauté scientifique pour décrire une succession de traitement automatique du signal à travers une chaîne de logiciels et d'algorithmes. Il est utilisé dans de nombreux domaines, dont la génomique, pour l'analyse des gènes et de leurs fonctions. L'utilisation d'un pipeline d'analyse permet à la fois d'automatiser l'analyse de données complexes, de gagner du temps et d'augmenter la reproductibilité de l'étude tout en étant assez flexible pour s'adapter aux besoins d'un projet.

Workflows sur mesure

Workflows sur mesure

Au cours des différents projets menés par SciLicium, plusieurs workflows d'analyse (transcriptomique, métagénomique) ont été mis en place et adaptés afin de répondre à votre question scientifique. SciLcium utilise les standards dans le domaine de l'édition de workflow (Snakemake, Nextflow, CWL) pour offrir une stabilité de l'analyse dans le temps.

Tous nos workflows sont développés ou adaptés à vos données et votre question de recherche.

Tous nos workflows sont livrés via un environnement (ou conteneur) dédié et déployés sur votre poste de travail (ou cluster).

Nous vous formons à l'utilisation du workflow et fournissons des instructions écrites pour son utilisation.

Avec votre workflow d'analyse, nous vous fournissons une maintenance de 6 mois comprenant des corrections de bugs, des mises à jour et un support client.

Des besoins d'un workflow d'analyse ?